核小体是真核细胞染色质的基本结构单位,由DNA和组蛋白构成,而没有核小体结合的DNA区域容易被核酸酶消 化,也易于与调控蛋白相结合,这些开放的DNA序列则可以使其下游的基因处于活跃表达的状态。细胞通过改变 DNA与组蛋白的结合位置从而调控基因的表达。因此,获得处于开放状态的DNA序列可用于研究基因表达的调控 机制,是表观遗传学研究的热点。
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是使用高通量测序 对Tn5转座酶易接近性染色质区域进行测序分析的一种表观遗传学研究技术,可获得在特定时空下全基因组染色 质开放区域,挖掘开放位点的潜在结合转录因子,结合基因表达水平数据,发现关键转录因子。