基于Illumina及其他二代测序平台组装得到的细菌基因组往往会存在不少“Gap”,而PacBio和Nanopore测序具有超长读长无GC偏好性的优势,能轻松覆盖微生物基因组中重复序列和异常GC含量的复杂区域,使细菌完成图成为可能。精确组装的细菌完成图,可以获知待测菌株的基因及相关调控信息,为研究该菌株特有的生物学特征(致病机制,共生机制,独有的代谢机制)提供分子生物学基础;通过比较基因组分析,为研究菌株种内及种间的功能差异、进化关系提供理论指导。
技术优势
超长读长:平均读长可达到20 ~30Kb;
单分子实时测序:测序过程无需扩增,不会人为的引入突变;覆盖均匀,无GC偏好性;
准确率高:通过reads的自我矫正,30X以上准确率能够达到99.999%(Q50);
碱基修饰检测:可直接检测6mA和4mC碱基修饰,应用于表观遗传学研究应用方向。
(1)医学健康领域:鉴定致病相关基因、开发和研究疫苗、开发新型抗生素等;
(2)食品科学领域:酸奶发酵,找到目标菌株生产特定代谢产物的核心基因;
(3)生物能源:产氢气甲烷菌,纤维素发酵等,研究特定功能的菌株。
技术路线
技术参数