ChIP-seq是研究组蛋白修饰和转录因子在基因组上结合 位置的有效技术手段,然而,由于其通常需要百万级别的 细胞量,且需要经过甲醛交联、超声物理性打断等步骤, 使得实验过程较复杂,数据背景噪音高且可重复性较差, 限制了数据结果的准确性和稀少样品的可应用性。
为了克服ChIP-seq的缺点,研究者开发了CUT&Tag (Cleavage Under Targets and Tagmentation)技术,该 技术运用连接有刀豆蛋白的磁珠结合细胞膜或细胞核, 通过抗体将Protein A-Tn5转座酶融合蛋白带到目标蛋白 附近进行染色质切割,并释放到细胞外,由于未对细胞核 和染色质进行物理性的破坏,整个操作过程相当“温和”, 因此CUT&Tag的背景噪音数据非常少,对起始细胞量的 要求大幅减少,且数据可重复性好。