染色质构象捕获(Chromatin Conformation Capture,3C)技术及其衍生技术正逐渐以越来越高的分辨率来深层次地揭示细胞核三维结构构造。Capture Hi-C技术是在Hi-C文库基础,针对目标区域(6Mb以下)设计探针,对目标区域的Hi-C文库进行捕获和测序,用于分析多个目标区域对应的全基因范围的互作,分辨率高,测序所需数据量低,对于调控转录的增强子与基因启动子远距离互作loop检测,Hi-C获得的是全基因组的互作信息,Promoter Capture Hi-C则对全基因组Promoter区域富集捕获测序。在获得相同分辨率情况,Capture Hi-C测序量和成本更低。目前常针对疾病样本中SNPs所在区域进行捕获及高深度测序,从而捕获SNP所在区域与全基因组互作信息,解析非编码区变异位点的潜在靶基因和致病性。
Capture Hi-C技术流程
技术路线
应用方向