威尼斯5848vip电子游戏(wns认证网站)-BinG百科

—— 常见问题 ——

农学科研 Agriculture Technology Services

产品介绍结果展示经典案例常见问题

常见问题

Q1：三代细菌基因组测序相对二代有哪些显著优势？

二代测序技术由于读长较短及碱基偏好性问题，难以解决基因组中重复区域及GC异常区域，三代测序平台，由于读长较长，不需要经过PCR扩增，可以一次性获得完整的细菌基因组图谱，实现没有gap和N碱基的组装，同时还可以获得质粒基因组信息。

Q2：contig成环，完成图，圈图分别指什么？

contig成环：是通过组装矫正后基因组的contig是否存在overlap判断；如果存在overlap，那么contig成环（交付的结果是去除overlap的）。

完成图：是指基因组组装完整，通常是所有的contig（不算质粒，部分菌有多个染色体）均成环；但有一些菌（放线菌）的基因组不是环状的，那么有没有组装成完成图，主要是通过contig两端是否存在反向重复序列（20kb左右）来判断。

圈图：是基因组的一种展示结果。

更多详细内容请点击该链接~

FAQ系列 | 细菌完成图你需要知道这么多！