Q1:lncRNA测序是否需要参考基因组?
需要,lncRNA测序需要通过参考基因组来确定其靶基因。一般要求做lncRNA测序的物种参考基因组需要组装到Scaffold水平,且具有比较完整的注释信息。
Q2:lncRNA如何从Total RNA中分离?
一般采用rRNA去除的方式从Total RNA中富集lncRNA,采用此方式获得的lncRNA测序数据中会含有mRNA信息。因此,lncRNA测序分析时,既会分析lncRNA,又会分析mRNA。
Q3:长链非编码RNA建库测序结果可以用于分析环状RNA吗?
可以,长链非编码RNA建库模式采用去核糖体方式建库,对所获得的RNA进行打断测序,相当于获得全部RNA,即可以进行分析环状RNA表达情况,可应用于分析各物种环状RNA表达谱。