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BSA分析助力揭示黄瓜黄色果肉呈色新机制

题目：Cucumber abscisic acid 8-hydroxylase Csyf2 regulates yellow flesh by modulating carotenoid biosynthesis

期刊：Plant Physiology

发表时间：2023年7月

材料选择：黄色果肉突变体yf-343与欧洲温室型黄瓜XUE1（白色果肉）杂交的F₂群体

主要研究方法：BSA-seq，转录组，代谢组

研究结果：

为了克隆控制黄色果肉的基因，以白色果肉自交系XUE1和yf-343为双亲构建分离群体进行遗传分析，结果表明：yf-343黄色果肉突变由单隐性基因控制，命名为yellow flesh-2(yf-2)。通过BSA-seq分析(SNP/InDel-index)方法，确定了Chr4上2.18 Mb的区域为候选区域。利用区间内8个多态性标记对F₂个体进行基因分型，基因型和表型数据连锁分析将yf-2基因座精细定位至4.6 cm区域。为了进一步缩小yf-2的候选区域，使用该区域的两个侧翼标记，从1000个F₂中鉴定了七个重组体，连锁分析将yf-2基因座精细定位到63.56 kb的区间。精细定位区间内有8个候选基因，结合序列比对及基因表达分析，明确编码脱落酸-8’-羟化酶（ABA8ox）的基因Csyf2为形成黄瓜黄色果肉的关键候选基因。

yf-2位点图位克隆

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