1、数据纠错
具备二代转录组数据的条件下,利用二代平台测序的高准确度序列进一步校正三代数据。
2、功能注释
利用数据库对全长转录本进行功能注释,基本功能注释包括NR、GO、KEGG、COG、Swiss-Prot。利用维恩图进行综合展示。
3、可变剪接分析
基于三代全长测序,直接基于全长Isoform序列识别可变剪接,更直接和准确的进行可变剪接事件的检测。
4、差异基因富集分析
基于GO和KEGG数据库对差异基因进行富集分析,以柱状图和散点图等形式展示。挖掘差异基因的功能及其所在的信号通路。
5、差异基因蛋白互作网络分析
利用STRING数据库,提取差异基因的互作关系来构建网络。