使用Micro-C解析小鼠ESCs细胞中染色质三维精细结构
使用Micro-C在超高分辨率下可以识别到promoter相关loops包括E-P/P-P互作,stripes,domain,以及Bundle contacts等结构,并发现转录活性高低与promoter相关的空间折叠程度相关。
小鼠ESCs细胞中染色质三维精细结构 (Tsung-Han S Hsieh. 2020, Molecular Cell)
使用Micro-C解析静止期酵母中基因表达抑制机制
使用Micro-C和ChIP-seq技术,发现静止期的酵母基因组上出现了由condensin介导的染色质环结构,并抑制了相关基因的表达。减少condensin的结合可以破坏染色质环结构并重新激活转录。
与对数期(Log)相比,静止期(Q)的酵母染色质形成了很多新的loops (Sarah G. Swygert. 2018, Molecular Cell)
模型:静止期的酵母细胞中,condensin在CID边界结合形成loops抑制基因表达 (Sarah G. Swygert. 2018, Molecular Cell)