Q1:Micro-C XL和Hi-C的区别
在实验上,Micro-C XL主要是交联条件和使用的酶与Hi-C不同。目前有应用文章显示,在同等测序深度时,Micro-C XL检测到的loops数较Hi-C更多。并且在达到一定深度时,Micro-C XL可以检测核小体级别的DNA互作结构。
Q2:Micro-C XL的样本要求
单次建库样本量:
(1)细胞系:≥107个细胞;
(2)血液:≥3mL(加入到EDTA抗凝管中,常温运输);
(3)动物组织:≥1g(肌肉、肝脏等);
(4)植物组织:≥2g(新鲜嫩叶);
样品运输:新鲜样品液氮速冻,干冰冷冻运输。